可以,但是要考两个不同的本科专业,因为自考本科学校跟专业都是相对应的,一般一个专业就对应一个本科院校,只有报两个不同的专业,才能拿到两个不同专业的自考本科毕业证书。建议不要同时报考两个学校,同时考的话在学习上的时间恐怕会很难调整。