科学家开发出一种细胞培养技术,可以在干细胞的微芯片上“克隆”微型人体肺,为研究COVID-19等肺部感染提供了一种新方法。这项技术揭示了肺泡细胞对SARS-CoV-2的易感性,并表明阻断某种信号通路可降低感染易感性。该平台在研究其他疾病、筛选药物、快速反应等方面也有潜在的应用前景防止未来的流行病。
当我们开车去一个新的目的地时,我们经常会按照指示关掉音响。原本的音乐突然听起来像噪音,干扰了我们的注意力。
我们对COVID等传染病如何影响人类肺部的理解同样受到噪音的困扰。来自患者肺组织的数据因人而异,这模糊了SARS-CoV-2究竟如何首先感染肺细胞的基本机制。这也是一种事后分析——就好像我们在试图绘制病毒带回三个州的路线一样。
从感染的第一刻起,通过研究基因相同的组织来降低变异的噪音,可能会照亮病原体的路径。哪些细胞被感染,何时被感染?感染的程度是什么?不同的细胞类型有什么不同?它在不同的条件下是如何变化的?
如果有可能同时追踪数千个感染病例呢?它可能会彻底改变我们对感染和用于对抗感染的药物治疗的理解。
这是能够在微芯片上培育微型器官的新先进技术的希望。洛克菲勒基金会的Ali Brivanlou和Charles M. Rice的实验室合作改进了一种细胞培养技术平台,可以培养基因相同的肺芽——胚胎产生我们呼吸器官的Nic结构——从人类胚胎干细胞(hESCs)。他们的研究结果最近发表在《干细胞报告》杂志上。
SARS-CoV-2(洋红色)感染从人类多能干细胞提取的体外迷你肺的肺泡和气道组织(蓝色)。来源:洛克菲勒大学合成生物学实验室
当将hESCs放置在微芯片阵列上,并小心地加入定制的信号分子鸡尾酒时,hESCs会迅速组织成具有完整组织复杂性的“微肺”。这些芽可以培养数千个,允许前所未有的高通量分析肺组织感染,没有所有嘈杂的变量。
其结果是无限制、快速和可扩展地获得具有人类肺部发育关键标志的肺组织,并可用于跟踪肺部感染和确定候选治疗方法。
“这些肺基本上是克隆的,”Ali Brivanlou说。“它们有完全相同的DNA特征。这样我们就不用担心每个病人的反应不同。量化使我们能够保持遗传信息不变,并测量关键变量——病毒。”
建立一个更好的迷你肺
胚胎干细胞是人体的原始细胞。它们可以无限分裂产生更多的干细胞或分化成任何其他组织。布里万卢的合成生物学实验室长期以来一直在探索它们的潜力。
在COVID大流行期间,布里万卢与洛克菲勒的同事查尔斯·m·赖斯(Charles M. Rice)合作:他的实验室拥有培养肺芽的微芯片技术,赖斯的实验室拥有必要的生物安全许可,可以用SARS-CoV-2感染它们并研究结果。
病毒颗粒(蓝色)感染肺泡和气道组织(红色)。来源:洛克菲勒大学合成生物学实验室
2021年,第一作者、布里万卢实验室的干细胞生物学家埃德温·罗萨多-奥利维亚里和莱斯大学病毒学和传染病实验室的博士后布兰登·拉祖基开始诱导细胞组织成更专门的形式。干细胞不是自己组织起来的。他们需要一个密闭的空间——比如一个微芯片井——以及激发变革的刺激。刺激来自诱导干细胞分化为特定细胞类型的四种主要信号通路。
大约两周后,该小组的肺细胞形成了相同的芽,其分子特征与胎儿肺发育早期阶段的芽非常吻合,包括气道和肺泡的形成,这些结构已知在许多患有严重COVID-19的人中受损。
找出罪魁祸首
从那以后,他们利用这个平台了解了SARS-CoV-2是如何感染不同的肺细胞的。
肺泡是位于肺分支末端的小囊,负责每次呼吸时的气体交换:吸入氧气,呼出二氧化碳。通过大量研究克隆肺泡细胞,研究人员发现肺泡比气道细胞更容易受到SARS-CoV-2感染,气道细胞是器官的守护者,是抵御所有吸入威胁的第一道防线。如果病毒通过了它们,肺泡就成了活靶子。
病毒颗粒(蓝色)感染肺泡和气道组织(红色)的另一视图。
他们还发现了一种成功的信号蛋白组合,这种组合是角质细胞生长因子(KGF)和骨形态发生蛋白4 (BMP4)的混合物,可以制造出最健壮的一批肺芽。两者都有助于细胞分化和生长。
有趣的是,BMP通路有一个缺点。当他们将感染的肺芽与COVID患者的死后组织进行比较时,他们发现BMP信号通路在两者中都被诱导,并使组织更容易受到感染。阻断BMP通路使细胞不那么脆弱。
除了COVID
研究人员指出,该平台还可用于研究流感、呼吸道合胞病毒、肺部疾病和肺癌等疾病的机制。此外,它还可以用来筛选治疗它们的新药。
肺并不是唯一的器官。Rosado-Olivieri说:“我们工作的更广泛的重点是了解细胞发育,以制造出我们可以用来模拟疾病和寻找治疗机制的合成器官和组织。”肝脏、肾脏和胰腺都可能是下一个目标。
Brivanlou补充说:“该平台还将使我们能够以更快和更精确的速度应对下一次大流行。”“我们可以迅速利用这个平台,使病毒可见,并比我们对COVID更快地开发治疗方法。它可用于筛选药物、化合物、疫苗、单克隆抗体,更直接地用于人体组织。这项技术已经准备好应对未来可能袭击我们的各种威胁。”
参考文献:“器官型人肺芽微阵列鉴定肺细胞中bmp依赖性SARS-CoV-2感染”,作者:E.A. Rosado-Olivieri, B. Razooky, J. Le Pen, R. De Santis, D. Barrows, Z. Sabry, h . h。Hoffmann, J. Park, T.S. Carroll, J. t . Poirier, C.M. Rice和A.H. Brivanlou, 2023年4月20日,干细胞报告。DOI: 10.1016 / j.stemcr.2023.03.015
这项研究调查了450名全职领薪的成年人。参与者完成了日常调查和问卷调查。从可穿戴设备收集的数据测量了睡眠时长和心率。根据这项研究,女性睡觉的可能性比男性高50%。打盹的人比其他受访者走的步数少,在睡眠时间受到的干扰也更多。