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皮虫毕竟是藻类-研究

   日期:2024-04-20 13:52:19     来源:http://www.900614.com/    作者:小编    浏览:118    

自15年前发现皮虫以来,科学家们一直困惑不已。这些普遍分布在全球的微生物比细菌大不了多少,但它们与动物、真菌和植物属于同一领域,从它们吃什么到它们在真核生物树中的位置,一切都很难确定。

现在,4月14日上传到bioRxiv的一份预印本声称已经发现了这些令人困惑的微生物的进化家园。但这篇目前正在接受同行评审的论文表明,皮虫并没有让科学家们感到惊讶。如果作者的结论是正确的,那么这些微生物确实是藻类,尽管它们似乎缺乏藻类最显著的特征:质体,一组包括叶绿体的细胞器。

小生物,大惊喜

2007年发表在《科学》杂志上的一篇论文宣布了这组浮游生物的发现,这震动了微生物生态学领域。瑞典乌普萨拉大学(Uppsala University)的分子原生生物学家法比安·布尔基(Fabien Burki)是最近这篇预印本的资深作者,他说:“我仍然清楚地记得,当我第一次读到这些生物的描述时,我在哪里。”当时,他是一名博士生,致力于解决真核生物生命之树的整体结构。突然间,有一个全新的、奇怪的分支需要考虑。

最初,由阿尔弗雷德·韦格纳极地和海洋研究所的琳达·梅德林领导的2007年研究的作者称这种生物为小胆藻,因为它们似乎是一种利用藻胆素色素进行光合作用的小型藻类,就像一些红藻一样。Burki说,考虑到藻类可以说是研究得最充分的浮游生物群体,以前没有记录的藻类本身就令人惊讶;数百年来,它们的颜色使它们成为受欢迎的研究对象。他说,没有人想到在21世纪会有主要的藻类谱系等待被发现。然而,在那里,这些生物被忽视了,因为它们直接通过了通常用于将较大的真核微生物(如藻类和浮游动物)与细菌分离的3微米过滤器。

一旦他们知道要寻找什么,研究人员就在不同地点的水样中,在表层和深海中都检测到了这些微生物,这表明它们无处不在。

2011年,当时在缅因州毕格罗海洋科学实验室(Bigelow Laboratory for Ocean Sciences)工作的微生物海洋学家迈克尔·西拉基(Michael Sieracki)和他的同事发现,核糖体基因序列并不能决定性地将皮虫与其他藻类联系起来,单细胞基因组学也无法检测到光合作用基因。Medlin的团队在2013年对一种浮游生物进行了短暂的培养,证实了这种微生物是异养生物的观点,并允许进行详细的显微镜观察,最终表明这些浮游生物是不含叶绿体或任何种类的质体的消费者。因此,picozoa一词被提出并被采用,pico是指它们的体型小,zoa是指它们像动物一样吃其他生物的生活方式。他们吃什么仍在调查中,尽管2020年Sieracki和他的同事在《微生物学前沿》的一项研究表明,病毒可能包含了他们饮食的很大一部分。

尽管如此,“植物”这个后缀表示植物性可能更合适,因为Burki的基因组数据表明,它们是红藻的姐妹群,正好位于藻类和植物的分类学“超级群”古藻的中间。

拼凑picozoan的拼图

另一张皮科莫的扫描电子显微照片 迈克尔·梅尔科尼安说

没有任何高质量的皮虫基因组序列。Burki说,因为没有建立长期培养的生物,基本上不可能获得深度测序所需的纯细胞数量。因此,他和他的同事转向单细胞基因组学,从单个细胞中获得了11个基因组,从多个细胞中拼接了6个基因组。当他们将这些与已建立的藻类和微生物真核生物基因组进行比较时,Picozoa显然属于始祖体。事实上,根据系统发育分析,在所有绿囊藻(glaucocystid algae)的祖先之后不久,它们就从它们的藻类亲戚中分离出来了。一组单细胞淡水藻类)和绿藻和陆地植物(绿藻)。

卡罗琳娜Fučíková是马萨诸塞州Assumption大学的一位心理学家,她告诉《科学家》杂志,该研究小组的系统基因组分析是“可靠的”和“复杂的”,但如果未来的分析结果与这种定位不一致,她也不会感到惊讶。她指出,进化枝的分支得到了很好的支撑,但古老的小分支总是受到一定程度的不确定性的影响。“每一个系统发育都是一个假设,所以我认为在未来,这个假设可能会得到更多数据的支持,或者它会发生变化。”

Sieracki现在是美国家科学基金会的项目官员,他也认为这篇论文令人印象深刻。他说:“这确实有助于把(picozoa)放在语境中。”尽管这与他早期工作中提出的进化关系有些不一致,但他对非光合作用组在古质体中的位置并不感到非常惊讶。藻类和其他单细胞真核生物已经有数十亿年的进化和生存策略,他指出,“植物与动物的整个概念是我们强加给这些生物的错误概念。”

Picozoan质体:丢失还是不存在?

除了系统基因组分析之外,Burki的研究小组还梳理了皮虫的基因组,寻找任何能证明它们曾经有过质体的证据,但没有发现任何证据。Burki说,尽管这与早期的研究一致,但仍然有点令人惊讶,因为这是前所未有的。他说:“一旦你有了这种细胞器,实际上很难失去它。”

虽然质体在光合作用中的作用最为人所知,但它们还参与其他必要的代谢过程。例如,它们制造类异戊二烯,而类异戊二烯是许多色素、维生素、激素和关键膜分子的基础。其中一些被认为是必需的营养物质,没有质体的生物体通过消耗有质体的生物体而获得。少数缺乏它们的始祖菌群是寄生虫,它们能够通过从宿主那里偷窃来弥补损失。

根据Burki的说法,皮虫似乎是唯一一种脱离了这些细胞器的自由生活的古质体。

Fučíková不太相信质体或它们的残余物不在那里;如果有更多的微生物培养数据,她会更有信心。“没有一种文化,它确实限制了你能做的事情,以及你能研究这些生物的程度,”她指出。她补充说,如果他们真的失去了孩子,她也不会感到震惊。她指出,科学家们对生活在10亿多年前的生物的生态学知之甚少;这些细胞器对最早的带有质体的生物体来说可能不是那么重要。

还有另一种可能更有争议的说法:皮虫从一开始就没有质体。

就像线粒体一样,质体是通过内共生产生的。Burki说:“实际上,广泛接受的假设或范式是,这是一个单一的事件。”“一群真核生物与一群细菌建立了这种关系,仅此而已。”

如果在微型动物体内真的没有质体的痕迹,那么要么它们消灭了最后的痕迹,要么它们从未有过质体。如果它们从未有过,那么它们与红藻的共同祖先也没有——这意味着质体必须至少在两个藻类群体中分别产生——红藻和所有其他藻类和植物。

根据他所看到的一切,Burki说他倾向于完全失去质体,尽管这是他所说的“极不可能发生的事情”。他补充说,另一种选择“会更令人兴奋”,新的发现可能会打破证据的平衡。他指出,科学家们刚刚开始对世界上的微生物真核生物的多样性进行排序,而那些生活在湖泊等地方的微生物真核生物的研究尤其不足。如果对它们的研究能揭示出更多不含质体的藻类谱系,那就能加强多质体起源的说法。

Fučíková表示,双重起源的情况并非不可能。“如果有两个内共生事件,但这些内共生菌来自非常密切相关的蓝藻,我们甚至会知道吗?”我们能分辨出来吗?”

文章链接:http://900614.com/news/show-86510.html
 
 
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